Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CGNQ9P2M7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CGNQ9P2M7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CGNQ9P2M7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms