Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN3Q9P1Z3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HCN3Q9P1Z3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN3Q9P1Z3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151 ms