Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH6

TMLHE, Trimethyllysine dioxygenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHEQ9NVH6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMLHEQ9NVH6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMLHEQ9NVH6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMLHEQ9NVH6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMLHEQ9NVH6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMLHEQ9NVH6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMLHEQ9NVH6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMLHEQ9NVH6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMLHEQ9NVH6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMLHEQ9NVH6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMLHEQ9NVH6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMLHEQ9NVH6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMLHEQ9NVH6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMLHEQ9NVH6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMLHEQ9NVH6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMLHEQ9NVH6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms