Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ATG3Q9NT62 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ATG3Q9NT62 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ATG3Q9NT62 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
ATG3Q9NT62 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ATG3Q9NT62 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ATG3Q9NT62 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ATG3Q9NT62 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ATG3Q9NT62 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ATG3Q9NT62 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ATG3Q9NT62 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ATG3Q9NT62 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ATG3Q9NT62 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATG3Q9NT62 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATG3Q9NT62 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATG3Q9NT62 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATG3Q9NT62 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATG3Q9NT62 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATG3Q9NT62 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATG3Q9NT62 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATG3Q9NT62 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATG3Q9NT62 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATG3Q9NT62 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
ATG3Q9NT62 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATG3Q9NT62 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATG3Q9NT62 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ATG3Q9NT62 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
ATG3Q9NT62 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATG3Q9NT62 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATG3Q9NT62 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATG3Q9NT62 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATG3Q9NT62 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATG3Q9NT62 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATG3Q9NT62 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ATG3Q9NT62 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ATG3Q9NT62 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ATG3Q9NT62 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ATG3Q9NT62 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ATG3Q9NT62 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ATG3Q9NT62 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ATG3Q9NT62 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
ATG3Q9NT62 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
ATG3Q9NT62 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ATG3Q9NT62 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ATG3Q9NT62 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ATG3Q9NT62 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ATG3Q9NT62 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ATG3Q9NT62 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ATG3Q9NT62 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ATG3Q9NT62 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATG3Q9NT62 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms