Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOMER2Q9NSB8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOMER2Q9NSB8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOMER2Q9NSB8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOMER2Q9NSB8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOMER2Q9NSB8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOMER2Q9NSB8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOMER2Q9NSB8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOMER2Q9NSB8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOMER2Q9NSB8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOMER2Q9NSB8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOMER2Q9NSB8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOMER2Q9NSB8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOMER2Q9NSB8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOMER2Q9NSB8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOMER2Q9NSB8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HOMER2Q9NSB8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOMER2Q9NSB8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOMER2Q9NSB8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOMER2Q9NSB8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOMER2Q9NSB8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOMER2Q9NSB8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOMER2Q9NSB8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOMER2Q9NSB8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOMER2Q9NSB8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOMER2Q9NSB8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOMER2Q9NSB8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOMER2Q9NSB8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOMER2Q9NSB8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOMER2Q9NSB8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms