Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPRMQ9NS64 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPRMQ9NS64 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRMQ9NS64 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRMQ9NS64 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRMQ9NS64 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRMQ9NS64 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRMQ9NS64 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRMQ9NS64 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRMQ9NS64 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRMQ9NS64 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRMQ9NS64 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRMQ9NS64 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPRMQ9NS64 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPRMQ9NS64 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms