Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DUOX1Q9NRD9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DUOX1Q9NRD9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms