Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDLIM7Q9NR12 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDLIM7Q9NR12 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDLIM7Q9NR12 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDLIM7Q9NR12 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDLIM7Q9NR12 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDLIM7Q9NR12 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDLIM7Q9NR12 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDLIM7Q9NR12 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDLIM7Q9NR12 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDLIM7Q9NR12 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDLIM7Q9NR12 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDLIM7Q9NR12 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDLIM7Q9NR12 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDLIM7Q9NR12 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDLIM7Q9NR12 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDLIM7Q9NR12 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDLIM7Q9NR12 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDLIM7Q9NR12 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDLIM7Q9NR12 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDLIM7Q9NR12 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms