Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
INCENPQ9NQS7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
INCENPQ9NQS7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms