Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX9Q9NQ69 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX9Q9NQ69 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms