Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP84

TNFRSF12A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 12A, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF12AQ9NP84 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF12AQ9NP84 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms