Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOPCQ9HD26 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOPCQ9HD26 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOPCQ9HD26 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOPCQ9HD26 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOPCQ9HD26 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOPCQ9HD26 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOPCQ9HD26 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOPCQ9HD26 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOPCQ9HD26 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOPCQ9HD26 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOPCQ9HD26 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOPCQ9HD26 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOPCQ9HD26 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOPCQ9HD26 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOPCQ9HD26 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOPCQ9HD26 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOPCQ9HD26 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOPCQ9HD26 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOPCQ9HD26 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
GOPCQ9HD26 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GOPCQ9HD26 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOPCQ9HD26 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOPCQ9HD26 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOPCQ9HD26 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOPCQ9HD26 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOPCQ9HD26 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms