Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCX3

ZNF304, Zinc finger protein 304, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF304Q9HCX3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF304Q9HCX3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF304Q9HCX3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms