Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PREBQ9HCU5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms