Protein–RNA interactions for Protein: Q9H987

SYNPO2L, Synaptopodin 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2LQ9H987 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNPO2LQ9H987 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNPO2LQ9H987 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms