Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C8orf33Q9H7E9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C8orf33Q9H7E9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C8orf33Q9H7E9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C8orf33Q9H7E9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms