Protein–RNA interactions for Protein: Q9H788

SH2D4A, SH2 domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4AQ9H788 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SH2D4AQ9H788 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SH2D4AQ9H788 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SH2D4AQ9H788 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SH2D4AQ9H788 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SH2D4AQ9H788 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SH2D4AQ9H788 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SH2D4AQ9H788 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SH2D4AQ9H788 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SH2D4AQ9H788 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SH2D4AQ9H788 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SH2D4AQ9H788 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SH2D4AQ9H788 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SH2D4AQ9H788 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SH2D4AQ9H788 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SH2D4AQ9H788 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SH2D4AQ9H788 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SH2D4AQ9H788 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SH2D4AQ9H788 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SH2D4AQ9H788 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SH2D4AQ9H788 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SH2D4AQ9H788 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SH2D4AQ9H788 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SH2D4AQ9H788 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SH2D4AQ9H788 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SH2D4AQ9H788 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SH2D4AQ9H788 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SH2D4AQ9H788 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SH2D4AQ9H788 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SH2D4AQ9H788 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SH2D4AQ9H788 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms