Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6S0

YTHDC2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC2Q9H6S0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
YTHDC2Q9H6S0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
YTHDC2Q9H6S0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
YTHDC2Q9H6S0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
YTHDC2Q9H6S0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
YTHDC2Q9H6S0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
YTHDC2Q9H6S0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
YTHDC2Q9H6S0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
YTHDC2Q9H6S0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
YTHDC2Q9H6S0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
YTHDC2Q9H6S0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
YTHDC2Q9H6S0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
YTHDC2Q9H6S0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
YTHDC2Q9H6S0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
YTHDC2Q9H6S0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
YTHDC2Q9H6S0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
YTHDC2Q9H6S0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
YTHDC2Q9H6S0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
YTHDC2Q9H6S0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
YTHDC2Q9H6S0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
YTHDC2Q9H6S0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
YTHDC2Q9H6S0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
YTHDC2Q9H6S0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
YTHDC2Q9H6S0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
YTHDC2Q9H6S0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
YTHDC2Q9H6S0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
YTHDC2Q9H6S0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
YTHDC2Q9H6S0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
YTHDC2Q9H6S0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
YTHDC2Q9H6S0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
YTHDC2Q9H6S0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
YTHDC2Q9H6S0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
YTHDC2Q9H6S0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
YTHDC2Q9H6S0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
YTHDC2Q9H6S0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
YTHDC2Q9H6S0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
YTHDC2Q9H6S0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
YTHDC2Q9H6S0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
YTHDC2Q9H6S0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
YTHDC2Q9H6S0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
YTHDC2Q9H6S0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
YTHDC2Q9H6S0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
YTHDC2Q9H6S0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
YTHDC2Q9H6S0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
YTHDC2Q9H6S0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
YTHDC2Q9H6S0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
YTHDC2Q9H6S0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
YTHDC2Q9H6S0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
YTHDC2Q9H6S0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
YTHDC2Q9H6S0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
YTHDC2Q9H6S0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
YTHDC2Q9H6S0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
YTHDC2Q9H6S0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
YTHDC2Q9H6S0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
YTHDC2Q9H6S0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
YTHDC2Q9H6S0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
YTHDC2Q9H6S0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
YTHDC2Q9H6S0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
YTHDC2Q9H6S0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
YTHDC2Q9H6S0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
YTHDC2Q9H6S0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
YTHDC2Q9H6S0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
YTHDC2Q9H6S0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms