Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EBF3Q9H4W6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms