Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NXF3Q9H4D5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NXF3Q9H4D5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NXF3Q9H4D5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NXF3Q9H4D5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NXF3Q9H4D5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NXF3Q9H4D5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NXF3Q9H4D5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NXF3Q9H4D5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NXF3Q9H4D5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NXF3Q9H4D5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NXF3Q9H4D5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NXF3Q9H4D5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NXF3Q9H4D5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NXF3Q9H4D5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NXF3Q9H4D5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NXF3Q9H4D5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NXF3Q9H4D5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NXF3Q9H4D5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NXF3Q9H4D5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NXF3Q9H4D5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NXF3Q9H4D5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NXF3Q9H4D5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NXF3Q9H4D5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NXF3Q9H4D5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NXF3Q9H4D5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NXF3Q9H4D5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NXF3Q9H4D5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms