Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM6Q9C030 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms