Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PUS3Q9BZE2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PUS3Q9BZE2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PUS3Q9BZE2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PUS3Q9BZE2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PUS3Q9BZE2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PUS3Q9BZE2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PUS3Q9BZE2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PUS3Q9BZE2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PUS3Q9BZE2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PUS3Q9BZE2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PUS3Q9BZE2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PUS3Q9BZE2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PUS3Q9BZE2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PUS3Q9BZE2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PUS3Q9BZE2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PUS3Q9BZE2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PUS3Q9BZE2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PUS3Q9BZE2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PUS3Q9BZE2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PUS3Q9BZE2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PUS3Q9BZE2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PUS3Q9BZE2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PUS3Q9BZE2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PUS3Q9BZE2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PUS3Q9BZE2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PUS3Q9BZE2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PUS3Q9BZE2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms