Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
BRIP1Q9BX63 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
BRIP1Q9BX63 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
BRIP1Q9BX63 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
BRIP1Q9BX63 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
BRIP1Q9BX63 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
BRIP1Q9BX63 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BRIP1Q9BX63 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
BRIP1Q9BX63 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BRIP1Q9BX63 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
BRIP1Q9BX63 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BRIP1Q9BX63 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BRIP1Q9BX63 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
BRIP1Q9BX63 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BRIP1Q9BX63 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BRIP1Q9BX63 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
BRIP1Q9BX63 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
BRIP1Q9BX63 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
BRIP1Q9BX63 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BRIP1Q9BX63 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
BRIP1Q9BX63 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
BRIP1Q9BX63 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
BRIP1Q9BX63 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
BRIP1Q9BX63 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
BRIP1Q9BX63 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BRIP1Q9BX63 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms