Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EFHD1Q9BUP0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFHD1Q9BUP0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms