Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDC1Q9BTX1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDC1Q9BTX1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms