Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTA3Q9BTC8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTA3Q9BTC8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTA3Q9BTC8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTA3Q9BTC8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MTA3Q9BTC8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTA3Q9BTC8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTA3Q9BTC8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTA3Q9BTC8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTA3Q9BTC8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTA3Q9BTC8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTA3Q9BTC8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTA3Q9BTC8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTA3Q9BTC8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTA3Q9BTC8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MTA3Q9BTC8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MTA3Q9BTC8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MTA3Q9BTC8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MTA3Q9BTC8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MTA3Q9BTC8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MTA3Q9BTC8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MTA3Q9BTC8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MTA3Q9BTC8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MTA3Q9BTC8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MTA3Q9BTC8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MTA3Q9BTC8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTA3Q9BTC8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTA3Q9BTC8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTA3Q9BTC8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTA3Q9BTC8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTA3Q9BTC8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTA3Q9BTC8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTA3Q9BTC8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTA3Q9BTC8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTA3Q9BTC8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTA3Q9BTC8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTA3Q9BTC8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTA3Q9BTC8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MTA3Q9BTC8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MTA3Q9BTC8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTA3Q9BTC8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MTA3Q9BTC8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MTA3Q9BTC8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MTA3Q9BTC8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTA3Q9BTC8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTA3Q9BTC8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTA3Q9BTC8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTA3Q9BTC8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTA3Q9BTC8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTA3Q9BTC8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MTA3Q9BTC8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MTA3Q9BTC8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MTA3Q9BTC8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MTA3Q9BTC8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MTA3Q9BTC8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MTA3Q9BTC8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTA3Q9BTC8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTA3Q9BTC8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTA3Q9BTC8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTA3Q9BTC8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MTA3Q9BTC8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTA3Q9BTC8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTA3Q9BTC8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTA3Q9BTC8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTA3Q9BTC8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTA3Q9BTC8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTA3Q9BTC8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTA3Q9BTC8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTA3Q9BTC8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms