Protein–RNA interactions for Protein: Q96S55

WRNIP1, ATPase WRNIP1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WRNIP1Q96S55 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
WRNIP1Q96S55 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
WRNIP1Q96S55 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187 ms