Protein–RNA interactions for Protein: Q96S06

LMF1, Lipase maturation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMF1Q96S06 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMF1Q96S06 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms