Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG1Q96Q15 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG1Q96Q15 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMG1Q96Q15 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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