Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PGLYRP2Q96PD5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGLYRP2Q96PD5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms