Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SAMD11Q96NU1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMD11Q96NU1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SAMD11Q96NU1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SAMD11Q96NU1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SAMD11Q96NU1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SAMD11Q96NU1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SAMD11Q96NU1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SAMD11Q96NU1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAMD11Q96NU1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAMD11Q96NU1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAMD11Q96NU1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAMD11Q96NU1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAMD11Q96NU1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAMD11Q96NU1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SAMD11Q96NU1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SAMD11Q96NU1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SAMD11Q96NU1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SAMD11Q96NU1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SAMD11Q96NU1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SAMD11Q96NU1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SAMD11Q96NU1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMD11Q96NU1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMD11Q96NU1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMD11Q96NU1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMD11Q96NU1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMD11Q96NU1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMD11Q96NU1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SAMD11Q96NU1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms