Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL15Q96M94 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms