Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZBED3Q96IU2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZBED3Q96IU2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ZBED3Q96IU2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZBED3Q96IU2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZBED3Q96IU2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
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