Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RBM17Q96I25 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RBM17Q96I25 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RBM17Q96I25 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RBM17Q96I25 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RBM17Q96I25 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RBM17Q96I25 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RBM17Q96I25 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RBM17Q96I25 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RBM17Q96I25 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RBM17Q96I25 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RBM17Q96I25 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RBM17Q96I25 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RBM17Q96I25 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RBM17Q96I25 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RBM17Q96I25 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RBM17Q96I25 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
RBM17Q96I25 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RBM17Q96I25 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RBM17Q96I25 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RBM17Q96I25 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms