Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV0

LRRC46, Leucine-rich repeat-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC46Q96FV0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC46Q96FV0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC46Q96FV0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC46Q96FV0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC46Q96FV0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC46Q96FV0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC46Q96FV0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC46Q96FV0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC46Q96FV0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC46Q96FV0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LRRC46Q96FV0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC46Q96FV0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC46Q96FV0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC46Q96FV0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC46Q96FV0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC46Q96FV0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC46Q96FV0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC46Q96FV0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms