Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTUB2Q96DC9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUB2Q96DC9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUB2Q96DC9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUB2Q96DC9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUB2Q96DC9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUB2Q96DC9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUB2Q96DC9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTUB2Q96DC9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTUB2Q96DC9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTUB2Q96DC9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUB2Q96DC9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUB2Q96DC9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUB2Q96DC9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUB2Q96DC9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTUB2Q96DC9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
OTUB2Q96DC9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms