Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP6V1E2Q96A05 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP6V1E2Q96A05 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms