Protein–RNA interactions for Protein: Q93052

LPP, Lipoma-preferred partner, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPPQ93052 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LPPQ93052 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LPPQ93052 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LPPQ93052 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LPPQ93052 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LPPQ93052 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LPPQ93052 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LPPQ93052 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LPPQ93052 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LPPQ93052 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LPPQ93052 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LPPQ93052 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LPPQ93052 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LPPQ93052 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LPPQ93052 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LPPQ93052 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LPPQ93052 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LPPQ93052 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LPPQ93052 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LPPQ93052 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LPPQ93052 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LPPQ93052 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LPPQ93052 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LPPQ93052 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LPPQ93052 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LPPQ93052 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LPPQ93052 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LPPQ93052 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LPPQ93052 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LPPQ93052 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LPPQ93052 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LPPQ93052 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LPPQ93052 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LPPQ93052 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LPPQ93052 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LPPQ93052 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LPPQ93052 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LPPQ93052 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LPPQ93052 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LPPQ93052 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LPPQ93052 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LPPQ93052 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LPPQ93052 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LPPQ93052 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LPPQ93052 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LPPQ93052 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LPPQ93052 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LPPQ93052 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LPPQ93052 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LPPQ93052 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LPPQ93052 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LPPQ93052 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LPPQ93052 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LPPQ93052 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LPPQ93052 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LPPQ93052 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LPPQ93052 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LPPQ93052 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LPPQ93052 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LPPQ93052 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LPPQ93052 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LPPQ93052 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LPPQ93052 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LPPQ93052 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LPPQ93052 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LPPQ93052 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LPPQ93052 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LPPQ93052 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LPPQ93052 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LPPQ93052 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LPPQ93052 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LPPQ93052 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LPPQ93052 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LPPQ93052 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LPPQ93052 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LPPQ93052 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LPPQ93052 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LPPQ93052 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LPPQ93052 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LPPQ93052 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LPPQ93052 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LPPQ93052 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LPPQ93052 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LPPQ93052 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LPPQ93052 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LPPQ93052 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LPPQ93052 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LPPQ93052 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LPPQ93052 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LPPQ93052 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LPPQ93052 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LPPQ93052 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LPPQ93052 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LPPQ93052 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LPPQ93052 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LPPQ93052 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LPPQ93052 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LPPQ93052 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LPPQ93052 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LPPQ93052 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms