Protein–RNA interactions for Protein: Q93050

ATP6V0A1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0A1Q93050 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP6V0A1Q93050 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP6V0A1Q93050 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP6V0A1Q93050 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP6V0A1Q93050 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP6V0A1Q93050 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP6V0A1Q93050 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP6V0A1Q93050 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP6V0A1Q93050 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP6V0A1Q93050 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP6V0A1Q93050 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP6V0A1Q93050 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP6V0A1Q93050 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP6V0A1Q93050 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP6V0A1Q93050 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP6V0A1Q93050 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP6V0A1Q93050 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP6V0A1Q93050 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP6V0A1Q93050 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP6V0A1Q93050 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP6V0A1Q93050 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP6V0A1Q93050 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP6V0A1Q93050 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP6V0A1Q93050 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP6V0A1Q93050 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP6V0A1Q93050 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP6V0A1Q93050 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP6V0A1Q93050 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP6V0A1Q93050 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.5 ms