Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP13Q92995 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP13Q92995 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP13Q92995 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP13Q92995 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP13Q92995 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP13Q92995 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP13Q92995 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP13Q92995 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP13Q92995 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP13Q92995 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP13Q92995 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP13Q92995 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP13Q92995 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP13Q92995 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP13Q92995 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP13Q92995 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP13Q92995 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP13Q92995 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP13Q92995 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP13Q92995 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP13Q92995 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP13Q92995 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP13Q92995 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP13Q92995 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP13Q92995 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP13Q92995 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP13Q92995 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP13Q92995 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP13Q92995 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP13Q92995 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP13Q92995 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP13Q92995 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP13Q92995 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP13Q92995 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP13Q92995 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP13Q92995 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP13Q92995 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP13Q92995 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP13Q92995 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP13Q92995 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP13Q92995 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP13Q92995 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP13Q92995 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP13Q92995 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP13Q92995 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP13Q92995 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP13Q92995 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP13Q92995 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP13Q92995 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP13Q92995 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP13Q92995 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP13Q92995 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP13Q92995 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP13Q92995 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP13Q92995 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP13Q92995 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP13Q92995 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP13Q92995 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP13Q92995 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP13Q92995 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP13Q92995 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP13Q92995 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP13Q92995 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP13Q92995 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP13Q92995 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP13Q92995 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP13Q92995 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP13Q92995 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP13Q92995 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP13Q92995 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP13Q92995 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP13Q92995 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP13Q92995 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP13Q92995 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP13Q92995 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP13Q92995 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP13Q92995 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP13Q92995 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP13Q92995 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP13Q92995 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP13Q92995 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP13Q92995 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP13Q92995 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP13Q92995 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP13Q92995 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP13Q92995 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP13Q92995 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP13Q92995 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP13Q92995 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP13Q92995 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP13Q92995 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP13Q92995 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP13Q92995 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP13Q92995 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP13Q92995 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP13Q92995 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP13Q92995 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP13Q92995 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP13Q92995 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms