Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF398Q8TD17 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.6 ms