Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHE23Q8NDY6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHE23Q8NDY6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE23Q8NDY6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
BHLHE23Q8NDY6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms