Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVH2

FOXP4, Forkhead box protein P4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP4Q8IVH2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXP4Q8IVH2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXP4Q8IVH2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXP4Q8IVH2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXP4Q8IVH2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXP4Q8IVH2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXP4Q8IVH2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXP4Q8IVH2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXP4Q8IVH2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXP4Q8IVH2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXP4Q8IVH2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXP4Q8IVH2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXP4Q8IVH2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXP4Q8IVH2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXP4Q8IVH2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXP4Q8IVH2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXP4Q8IVH2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms