Protein–RNA interactions for Protein: Q86WT6

TRIM69, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM69, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM69Q86WT6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM69Q86WT6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM69Q86WT6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM69Q86WT6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM69Q86WT6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM69Q86WT6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM69Q86WT6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM69Q86WT6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM69Q86WT6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM69Q86WT6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM69Q86WT6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM69Q86WT6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM69Q86WT6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM69Q86WT6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM69Q86WT6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM69Q86WT6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM69Q86WT6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM69Q86WT6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM69Q86WT6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM69Q86WT6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM69Q86WT6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM69Q86WT6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM69Q86WT6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM69Q86WT6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM69Q86WT6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM69Q86WT6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM69Q86WT6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM69Q86WT6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM69Q86WT6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM69Q86WT6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM69Q86WT6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms