Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALYREFQ86V81 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALYREFQ86V81 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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