Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6J0

SH3RF1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF1Q7Z6J0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SH3RF1Q7Z6J0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SH3RF1Q7Z6J0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SH3RF1Q7Z6J0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH3RF1Q7Z6J0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH3RF1Q7Z6J0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH3RF1Q7Z6J0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SH3RF1Q7Z6J0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SH3RF1Q7Z6J0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SH3RF1Q7Z6J0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SH3RF1Q7Z6J0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SH3RF1Q7Z6J0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SH3RF1Q7Z6J0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SH3RF1Q7Z6J0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SH3RF1Q7Z6J0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH3RF1Q7Z6J0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH3RF1Q7Z6J0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH3RF1Q7Z6J0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH3RF1Q7Z6J0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH3RF1Q7Z6J0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH3RF1Q7Z6J0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SH3RF1Q7Z6J0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH3RF1Q7Z6J0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH3RF1Q7Z6J0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SH3RF1Q7Z6J0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SH3RF1Q7Z6J0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SH3RF1Q7Z6J0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SH3RF1Q7Z6J0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SH3RF1Q7Z6J0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH3RF1Q7Z6J0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SH3RF1Q7Z6J0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms