Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZD4Q76G19 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDZD4Q76G19 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDZD4Q76G19 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms