Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUC0

TFAP2E, Transcription factor AP-2-epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2EQ6VUC0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TFAP2EQ6VUC0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms