Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMCO3Q6UWJ1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMCO3Q6UWJ1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMCO3Q6UWJ1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMCO3Q6UWJ1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TMCO3Q6UWJ1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMCO3Q6UWJ1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMCO3Q6UWJ1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMCO3Q6UWJ1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMCO3Q6UWJ1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMCO3Q6UWJ1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMCO3Q6UWJ1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMCO3Q6UWJ1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMCO3Q6UWJ1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMCO3Q6UWJ1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMCO3Q6UWJ1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMCO3Q6UWJ1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMCO3Q6UWJ1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMCO3Q6UWJ1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMCO3Q6UWJ1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMCO3Q6UWJ1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMCO3Q6UWJ1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMCO3Q6UWJ1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMCO3Q6UWJ1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMCO3Q6UWJ1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TMCO3Q6UWJ1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMCO3Q6UWJ1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMCO3Q6UWJ1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TMCO3Q6UWJ1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMCO3Q6UWJ1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMCO3Q6UWJ1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms