Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFXN4Q6P4A7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFXN4Q6P4A7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFXN4Q6P4A7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SFXN4Q6P4A7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFXN4Q6P4A7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFXN4Q6P4A7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFXN4Q6P4A7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFXN4Q6P4A7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFXN4Q6P4A7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFXN4Q6P4A7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFXN4Q6P4A7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFXN4Q6P4A7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFXN4Q6P4A7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFXN4Q6P4A7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFXN4Q6P4A7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFXN4Q6P4A7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFXN4Q6P4A7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFXN4Q6P4A7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFXN4Q6P4A7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFXN4Q6P4A7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SFXN4Q6P4A7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SFXN4Q6P4A7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SFXN4Q6P4A7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms